生命數據系統的條形碼

生命數據系統的條形碼(通常稱為大膽的或者大膽的系統)是專門用於DNA條形碼.[1][2]它是加拿大生物多樣性基因組中心開發的基於雲的數據存儲和分析平台。它由四個主要模塊,一個數據門戶,一個教育門戶,垃圾箱註冊表(推定物種)以及數據收集和分析工作台組成,該工作台提供了一個用於分析的在線平台DNA序列.[2]自2005年推出以來,BOLD已擴展到提供一系列功能,包括數據組織,驗證,可視化和發布。該系統的最新版本是2017年推出的版本4,帶來了一系列支持數據收集和分析的改進,但還包括新的功能改善數據傳播,引用和註釋。[3]在2020年11月16日之前,BOLD已包含318,105種正式描述的物種的條形碼序列,其中涵蓋了動物,植物,真菌,生物(約890萬標本)。[4]

大膽的任何有興趣的研究人員都可以免費獲得DNA條形碼。通過提供專業服務,它有助於出版符合獲得標準的記錄條碼國際核苷酸序列數據庫中的名稱。由於其基於Web的交付和靈活的數據安全模型,它也可以很好地支持涉及廣泛研究聯盟的項目。[3]

BOLD的數據發布主要起源於項目條形碼500K[5]從2010年至2015年由國際生命金屬(IBOL)財團執行。它的目的是為500萬個代表500k種的標本的DNA條形碼記錄進行數據獲取。所有標本集,序列分配,信息分類均由世界各國的大量科學家,合作者和設施做出貢獻。數據積累提高了DNA條形碼識別的準確性,並促進了生命的條形碼。

參考

  1. ^Ratnasingham,Sujeevan;Hebert,Paul D. N.(2013)。“所有動物物種的基於DNA的註冊表:條形碼指數編號(bin)系統”.PLOS ONE.8(7):E66213。Bibcode2013 PLOSO ... 866213R.doi10.1371/journal.pone.0066213.ISSN 1932-6203.PMC 3704603.PMID 23861743.
  2. ^一個bRatnasingham,Sujeevan;Hebert,Paul D. N.(2007-01-24)。“條形碼:粗體:生命數據系統的條形碼(http://www.barcodinglife.org)”.分子生態學註釋.7(3):355–364。doi10.1111/j.1471-8286.2007.01678.x.ISSN 1471-8278.PMC 1890991.PMID 18784790.
  3. ^一個b“大膽的Bold Brint手冊”.www.boldsystems.org。檢索2020-11-16.
  4. ^“生命的王國是條形碼|勇敢的系統”.www.boldsystems.org。檢索2020-11-16.
  5. ^“條形碼500K”.ibol.org.

外部鏈接